La Médiatrice est indépendante. Elle ne fait partie d’aucune direction de France compétences et n’a aucun lien avec les opérateurs régionaux chargés de dispenser le conseil en évolution professionnelle (CEP) ou de financer les projets de transitions professionnelles (PTP). Elle a pour rôle de tenter de trouver une solution entre les parties et pour cela, elle émet des avis ou recommandations sur les différends qui lui sont adressés. Si la Médiatrice constate, dans un dossier, que son indépendance ou son impartialité peut être affectée en raison d’un conflit d’intérêt, elle est obligée de se déporter et de refuser de poursuivre la médiation.