Il prépare et contrôle le budget de l’établissement et en assure la gestion du personnel. Il assure également la publication de la liste actualisée des certifications professionnelles enregistrées au Répertoire national des certifications professionnelles et au Répertoire spécifique des certifications et des habilitations.
Enfin, il rend compte de sa gestion au Conseil d’administration, au ministre chargé de la formation professionnelle ainsi que devant le Parlement.